برنامج الدكتوراه :

يتوفر برنامج الدكتوراه لجميع الكليات التالية و في جميع التخصصات من خلال برنامج البحث و المقررات الدراسية:

1. كلية الاقتصاد   - درجة الدكتوراه بالمقررات الدراسية في الاقتصاد الاسلامي - وبالبحث في كل التخصصات
2. كلية العلوم الإدارية - درجة الدكتوراه بالمقررات في المحاسبة و إدارة الاعمال DBA
3. كلية الصيدلة
4. كلية اصول الدين - درجة الدكتوراه بالبحث و المقررات الدراسية في -القراءات -التفسير وعلوم القرآن -السيرة والشمائل -العقيدة الاسلامية - السنة وعلوم الحديث
5. كلية الدعوة
6. كلية الشريعة والقانون - درجة الدكتوراه بالبحث و المقررات الدراسية في - الفقه المقارن - أصول الفقه - القانون المقارن
7. كلية التربيه
8. كلية اللغة العربية
9. كلية الأداب
10. كلية الأعلام درجة الدكتوراه  بالبحث و المقررات في - الإذاعة و التلفاز - و الصحافة والنشر و العلاقات العامة -
11. كلية الزراعه
12. كلية العلوم والتقانة
13. كلية الهندسة
14. كلية المختبرات الطبية تمنح الكليه درجة الدكتوراه بالبحث العلمي فقط في التخصصات الطبية - الاحياء الدقيقة الطبيه - الكيمياء السريريه - أمراض الدم والمناعه الدمويه - الأنسجة المريضه والخلايا - الطفيليات الطبيه والحشرات.